民間軍需会社のカイザーは、≪機械恐竜帝国≫の依頼を受けて地球に散らばった“エターナルコア”を探している。
“赤竜”が永い眠りから覚めると、≪機械恐竜帝国≫が直接動き出したことに疑問を抱いたカイザーは、ジンについても調べ始める。ジンは「Ｄアーマー・アカデミー」への転校手続きのため学校に向かう。「≪Ｄアーマー≫の存在は誰にも話してはいけない」という教官の言葉を忘れ、友人たちを学校の屋上に連れて行き、≪Ｄアーマー≫の無人操縦ヘリを自慢するジン。その時、カイザーのドローンがジンを発見して連れて行こうとする。ガーディアンズのおかげでその危機を免れたジン。しかし、身の回りで起こる事件に戸惑うばかりだった。